המחלקה לכלי נשיפה ונקישה מציעה מסלול לימודים בכל הכלים הסטנדרטים עם מיטב המורים בישראל. הלימודים כוללים, שיעורים פרטניים, סדנאות למוסיקה קאמרית, שיעורי מתודיקה, תחרויות שנתיות, נגינה בתזמורת סמפונית וכיתות אמן עם אמנים בעלי שם עולמי.

בוגרים יקרים,
 

מדי שנה מעניקה האקדמיה מלגות בתחום העשייה הקאמרית מתוך ההבנה שעשייה קאמרית איכותית היא אחד מאמצעי הלימוד היעילים והמהנים ביותר לקידום יכולותיהם של תלמידי המוסיקה המצטיינים. המלגות מחולקות לאחר בחינות מיוחדות לתכנית. הזוכים מחולקים להרכבים קאמריים שמקבלים הנחייה שבועית מאחד מהמורים הקאמריים בסגל. מדי סמסטר נקבעים מספר "ערבים קאמריים" בהם מנגנים כל ההרכבים תחת ההנחיה של ראש התכנית הויולן צבי כרמלי. ההרכבים קאמריים מוזמנים לנגן בקונצרטים חשובים בארץ וכן לנסיעות לחו"ל בהם הם מייצגים את האקדמיה. בשנה החולפת נסעו תלמידי התכנית לאיטליה, גרמניה, הונגריה, קנדה ועוד.

מקהלת הסטודטים, בניצוחו וניהולו המוסיקלי של מר עודד שומרוני, הינה אחד מהגופים המבצעים של האקדמיה. משתתפים בה כל אותם סטודנטים שאינם חברי גוף מבצע ייצוגי אחר (התזמורת הקאמרית או המקהלה הקאמרית). רפרטואר המקהלה משלב יצירות א-קפלה, יצירות בליווי פסנתר ויצירות למקהלה ותזמורת. בשנים עברו ביצעה המקהלה יצירות כמו המיסה בדו מינור של מוצארט, רקוויאם של שומאן ומיסה של שוברט.