הפקולטה לקומפוזיציה, ניצוח וחינוך מוסיקלי מורכבת משני חוגים: החוג לקומפוזיציה, ניצוח ותורת המוסיקה והחוג לחינוך מוסיקלי. תוכניות הלימודים בחוגים אלו מובילות לקראת התואר הראשון בוגר במוסיקה B.Mus., בוגר בחינוך מוסיקלי B.ed Mus. והתואר שני מוסמך במוסיקה M.Mus. בתחומי ההתמחות הראשיים קומפוזיציה, ניצוח או חינוך מוסיקלי.
תוכניות הלימודים לתואר ראשון בפקולטה מבוססות על מספר מקצועות ליבה, המקנים לתלמידים יסודות איתנים במיומנויות ההכרחיות למוסיקאים ולמורים. בחוג לקומפוזיציה וניצוח, בנוסף ללימוד היחידני במקצוע הראשי, תופסים מקום חשוב מקצועות תורת המוסיקה, פיתוח השמיעה והשליטה בפסנתר. דגש רב מושם על כתיבה סגנונית במיומנות גבוהה, קריאת פרטיטורות ותורת התזמור.
בחוג לחינוך מוסיקלי נודעת חשיבות לכלי הראשי, מתוך מחשבה שמורה חייב להיות בראש ובראשונה מוסיקאי פעיל ומיומן. עליו נוספים קורסים בכלי משנה, שורה של קורסים בפדגוגיה, דידקטיקה, פסיכולוגיה התפתחותית וכמובן עבודה מעשית. תוכנית הלימודים לקראת התואר השני כוללת קורסי התמחות וסמינרים ספציפיים לפי תחום הלימודים. התלמידים המסיימים את לימודיהם לקראת זה עומדים בדרישות גבוהות בהתאם למצופה בתחום התמחותם.
הפקולטה אחראית גם לכל הקורסים העיוניים במקצועות השונים בתורת המוסיקה ומחשבת המוסיקה הניתנים לכלל הסטודנטים בפקולטה לאמנויות הביצוע. כמו כן מעניקה הפקולטה קורסים ספציפיים במוסיקה הניתנים לתלמידי הפקולטה למחול ותנועה, ומקצועות אקדמיים כלליים, שהם חלק מתוכנית הלימודים המלאה של כלל הסטודנטים באקדמיה.
חברי הסגל האקדמי בפקולטה ידועים במסירותם הרבה לסטודנטים ומקצועיותם בתחומי התמחותם, והפקולטה שומרת על מוניטין המצוינות המאפיין אותה מזה שנים רבות בכל תחומי הלימוד, הן במקצועות הראשיים-קומפוזיציה, ניצוח וחינוך מוסיקלי, והן בקורסים הרבים המוענקים לכלל אוכלוסיית הסטודנטים בפקולטות האחיות.